Stichting Pastoraat Oude Wijken Rotterdam-Zuid is de opvolger van Wijkpastoraat Bloemhof. Dit wijkpastoraat in de achterstandswijk Bloemhof in Rotterdam-Zuid is in de jaren ’60 van de vorige eeuw ontstaan vanuit de gereformeerde kerken om op grond van het evangelie mensen te ondersteunen in zaken die hún bestaan bepalen en in hún strijd om menswaardig te mogen leven. Door trouw aan deze mensen is vertrouwen opgebouwd en hebben kerkelijke vrijwilligers geleerd dat zijzelf veel konden leren van het geloof en vertrouwen van bewoners in armoede die in de achterstandswijk woonden.
In de jaren ’70 vertrokken bewoners die het maatschappelijk beter kregen uit Bloemhof naar andere wijken. ‘Gastarbeiders’ vestigden zich in de wijk met hun gezinnen. Het bestuur van de kerk besloot met het vertrek van kerkleden naar andere wijken, om de Putsepleinkerk af te breken en in de plaats daarvan een Welkomcentrum voor de nieuwe bewoners van de buurt te bouwen. Een centrum waar zij ondersteund konden worden in zaken die hún bestaan bepaalden. De vertrouwensband die al was ontstaan met moslims en gelovigen uit Afrikaanse en Zuid-Amerikaanse landen werd daarmee versterkt.
Vanaf 1987 is het Welkomcentrum De Put de uitvalsbasis geworden voor het samenwerken met bewoners van verschillende culturele achtergronden en het ondersteunen van bewoners in zaken die hún bestaan bepalen voor een menswaardig leven.
In de jaren ’80 is met andere wijkpastoraten in Rotterdam een samenwerkingsverband opgericht, zodat beroepskrachten en vrijwilligers in de 5 verschillende wijken van elkaar konden leren. Ook werd de stichting Beheer Pastoraat Oude Wijken opgericht om het gezamenlijke werk in de wijken financieel te kunnen ondersteunen. In 2014 is besloten dat het financieel niet meer mogelijk was om de overhead van deze stichting gefinancierd te krijgen en is besloten tot decentralisering. Wijkpastoraat Bloemhof heeft toen besloten de stichting Pastoraat Oude Wijken Rotterdam-Zuid op te richten als rechtspersoon voor het uitvoerende werk in Bloemhof en omstreken.